オランダでは、サイエントロジー教会の宗教上の位置付けや性質に関する政府との論争はありません。 何年にもわたり、行政機関と裁判所の両方により、サイエントロジーを宗教と認定し、教会員に宗教サービスを提供する宗教団体としてサイエントロジー教会を認可する文書が数多く発行されてきました。 サイエントロジー教会は宗教団体として登記され、法人格を取得しています。
オランダの複数の政府機関が、教会、その教会員、聖職者に対する処遇を通じて、サイエントロジー宗教を認知していることを表明しています。 例えば、司法省はサイエントロジーの聖職者に刑務所を訪問して受刑者にカウンセリングや奉仕を提供する資格を認めています。教育局はサイエントロジストが自身の信仰に沿った形で自分の子供を教育できるよう、独自の学校を設立する権利を認めています。税務署はサイエントロジーの宗教としての地位を受け入れています。
2007年に、サイエントロジーのある教会員が、自分の娘を自身とその子の宗教的信仰に基づいて家庭で教育することを裁判所に訴え、認められました。 裁判所はこの判決に際し、サイエントロジー教会 対 モスクワの訴訟(2007年4月5日 申請番号 18147/02)におけるヨーロッパ人権裁判所の裁定に依拠しました。 1991年、税務調査官がその上司から、サイエントロジーの聖職者の所得税申告に対する扱いを、宗教の平等と非差別の原則に則って、他の宗教の聖職者と同じにするようにとの指導を受けました。
「裁判所は…サイエントロジーを宗教運動として認定した2007年4月5日付ヨーロッパ人権裁判所の判決(申請番号 18147/02)を考慮した。」